Связь однонуклеотидного полиморфизма гена CYP19A1 rs2414098 с риском развития эндометриоидной аденокарциномы
УДК 616.14-006.66
Р.И. ГАБИДУЛЛИНА1, Г.А. СМИРНОВА2, Ф.Р. НУХБАЛА1, Е.В. ВАЛЕЕВА1, Ю.И. ОРЛОВА1, А.А. ШАКИРОВ1, А.Ф. АХМЕТЗЯНОВА3, Г.Р. ФАХРУТДИНОВА3
¹Казанский государственный медицинский университет МЗ РФ, г. Казань
²Городская клиническая больница №7, г. Казань
3Республиканский клинический онкологический диспансер МЗ РТ, г. Казань
Контактная информация:
Габидуллина Рушанья Исмагиловна ― доктор медицинских наук, профессор кафедры акушерства и гинекологии им. проф. В.С. Груздева
Адрес: 420012, г. Казань, ул. Бутлерова, д. 49, e—mail: ru.gabidullina@yandex.ru
Цель исследования ― определить частоту полиморфизма гена CYP19A1 (rs2414098) у пациенток с раком эндометрия и здоровых женщин, проживающих на территории Республики Татарстан.
Материал и методы. В исследование включены 161 жительница Республики Татарстан. Группу сравнения составили 60 пациенток с раком эндометрия (эндометриодной аденокарциномой), контрольная группа была сформирована из 101 женщины без патологии эндометрия. Возраст обследуемых пациенток составил от 41 до 91 года. Определение SNP гена СYP19А1 (rs2414098) было проведено методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. Был проведен χ2-тест, а также был оценен показатель отношения шансов.
Результаты. Установлено, что шанс развития рака эндометрия оказался выше у носителей аллеля С (ОШ=1,88, 95% ДИ 1.15 – 3.06, р=0,01) и генотипа С/С (ОШ=2,11, 95% ДИ 1.10 – 4.05, р=0,04) SNP гена молекулы СYP19А1 (rs2414098).
Заключение. Наличие аллеля С и генотип С/С SNP гена молекулы СYP19А1 являются факторами риска, предрасполагающими к развитию эндометриодной аденокарциномы у женщин, проживающих на территории Республики Татарстан.
Ключевые слова: рак эндометрия, генетический полиморфизм, наследственная предрасположенность.
(Для цитирования: Габидуллина Р.И., Смирнова Г.А., Нухбала Ф.Р., Валеева Е.В., Орлова Ю.И., Шакиров А.А., Ахметзянова А.Ф., Фахрутдинова Г.Р. Связь однонуклеотидного полиморфизма гена CYP19A1 rs2414098 с риском развития эндометриоидной аденокарциномы. Практическая медицина. 2019. Том 17, № 4, С. 68-71)
DOI: 10.32000/2072-1757-2019-4-68-71
R.I. GABIDULLINA1, G.A. SMIRNOVA2, F.R. NUKHBALA1, E.V. VALEEVA1, Yu.I. ORLOVA1, A.A. SHAKIROV1, A.F. AKHMETZYANOVA3, G.R. FAKHRUTDINOVA3
1Kazan State Medical University, Kazan
2City Clinical Hospital №7, Kazan
3Tatarstan Cancer Center, Kazan
Relationship of the single nucleotide polymorphism of the CYP19A1 rs2414098 gene with the risk of endometrioid adenocarcinoma
Contact details:
Gabidullina R.I. ― MD, Professor of the Department of Obstetrics and Gynecology named after Prof. V.S. Gruzdev
Address: 49 Butlerov Str., Kazan, Russian Federation, 420012, e-mail: ru.gabidullina@yandex.ru
Objective ― to determine the frequency of polymorphism of the CYP19A1 gene (rs2414098) in patients with endometrial cancer and healthy women living in the Republic of Tatarstan.
Material and methods. The study included 161 residents of the Republic of Tatarstan. The comparison group consisted of 60 patients with endometrial cancer (endometrial adenocarcinoma), the control group was assembled from 101 women without endometrial pathology. The age of the examined patients ranged from 41 to 91 years. The SNP of the CYP19A1 gene (rs2414098) was determined by real-time polymerase chain reaction. The χ2 test was conducted, and the odds ratio was evaluated.
Results. It was found that the chance of developing endometrial cancer was higher in carriers of the C allele (OR=1.88, 95% CI 1.15 – 3.06, p=0.01) and the C/C genotype (OR=2.11, 95% CI 1.10 – 4.05, p=0.04) of the SNP of the CYP19A1 gene molecule (rs2414098).
Conclusion. Presence of the C allele and the C/C SNP genotype of the CYP19A1 molecule is the risk factor predisposing to the development of endometrial adenocarcinoma in women living in the Republic of Tatarstan.
Key words: endometrial cancer, genetic polymorphism, genetic predisposition.
(For citation: Gabidullina R.I., Smirnova G.A., Nukhbala F.R., Valeeva E.V., Orlova Yu.I., Shakirov A.A., Akhmetzyanova A.F., Fakhrutdinova G.R. Relationship of the single nucleotide polymorphism of the CYP19A1 rs2414098 gene with the risk of endometrioid adenocarcinoma. Practical medicine. 2019. Vol. 17, № 4, P. 68-71)
В России наибольший удельный вес в структуре онкологической заболеваемости женщин имеют злокачественные новообразования органов репродуктивной системы (39,2%), при этом опухоли половых органов составляют 18,2% всех злокачественных новообразований у женщин [1]. Рак эндометрия является четвертым по распространенности раком у женщин в странах Европы и США и наиболее распространенным раком женской репродуктивной системы [2, 3]. Наследственный относительный риск составляет ~2 [4], но высоко проникающие зародышевые мутации в генах репарации ошибочно спаренных нуклеотидов [5] и генах ДНК-полимеразы [6] составляют лишь небольшую долю общего риска. В 2016 году группа ученых из Исследовательского центра генетики человека (Оксфордский университет, Великобритания) опубликовала результаты работы, в которой провела полногеномный поиск ассоциаций (GWAS) рака эндометрия с 7 737 случаями рака эндометрия и 37 144 случаями контроля среди людей европеоидной расы. Внедрение и метаанализ всего генома выявили семь локусов риска значимости для всего генома, среди которых полиморфизм гена CYP19A1 (rs2414098) [7,8].
Цель исследования ― определить частоту полиморфизма гена CYP19A1 (rs2414098) у пациенток с раком эндометрия и здоровых женщин, проживающих на территории Республики Татарстан.
Материал и методы
В исследование, проводившееся в 2014-2018 гг., включены 161 жительница Республики Татарстан. Группу сравнения составили 60 пациенток с раком эндометрия (эндометриодной аденокарциномой), контрольная группа была сформирована из 101 женщины без патологии эндометрия. Возраст обследуемых пациенток составил от 41 до 91 года, средний возраст в группе сравнения ― 61,3±8,8 лет, в группе контроля ― 65,5±5,4 лет (p>0,05).
Критерии включения женщин в исследование: проживание в Республике Татарстан, белая раса, выявление на момент исследования рака эндометрия (эндометриоидного рака) или отсутствие патологии эндометрия. Критериями исключения пациенток из исследования были полипы эндометрия, гиперплазия эндометрия и сочетанные виды рака. Набор женщин в группы был произведен по результатам гистологического исследования биопсийного и операционного материала.
Определение SNP (от англ. single nucleotide polimorfizm — полиморфизмы одиночных нуклеотидов) гена СYP19А1 (rs2414098) было проведено методом полимеразной цепной реакции в реальном времени с помощью наборов реактивов фирмы НПК «СИНТОЛ» (Москва, Россия). Предварительно была выделена ДНК из лейкоцитов крови пациенток с помощью наборов реагентов «Проба Рапид-Генетика» ООО «ДНК-Технология» (Москва, Россия). Амплификация и детекция участков исследуемых генов была выполнена на амплификаторе «ДТ-96» (Москва, Россия).
Статистическая обработка полученных результатов проводилась с использованием пакета прикладных программ InStat 3 GraphPad (Instat Consulting, Inc), а также программного обеспечения Microsoft Office Excel 2013 (15) для Microsoft Windows. Для проверки гипотезы о законе распределения использовался критерий Колмогорова ― Смирнова и Шапиро ― Уилка. Для определения статистической значимости различий средних величин при нормальном распределении применялся t-критерий Стьюдента. За уровень значимости в исследовании был принят уровень р<0,05. Проводилась оценка подчинения распределения генотипов выборок равновесию Харди ― Вайнберга и χ2-тест, а также был оценен показатель отношения шансов (далее ― ОШ). Для вычислений использовали программу «Калькулятор для расчета статистики в исследованиях случай-контроль» (http:/gen-exp.ru/calculator_or.php).
Результаты исследования и их обсуждение
При анализе однонуклеотидных полиморфизмов гена CYP19A1 (rs2414098) было выявлено, что мутантная аллель С у жительниц Республики Татарстан, страдающих раком эндометрия, встречается в 1,88 раза статистически значимо чаще, чем в группе контроля. Частота встречаемости аллели С у пациенток 2 группы сравнения и контрольной группы составила 0,725 и 0,584 соответственно (χ2=6,46, р=0,01; табл. 1). Частота встречаемости аллели А также имела статистически значимые отличия между группами и составила у женщин с раком эндометрия 0,275, при отсутствии патологии эндометрия — 0,416 (χ2=6,46, р=0,01).
Таблица 1. Мультипликативная модель наследования CYP19A1 (rs2414098)
Table 1. Multiplicative model of inheritance CYP19A1 (rs2414098)
Аллели | РЭ | Контроль | χ2 | p | OШ | |
n=60 | n=101 | значение | 95% ДИ | |||
Аллель С | 0.725 | 0.584 | 6.46 | 0.01 | 1.88 | 1.15 – 3.06 |
Аллель А | 0.275 | 0.416 | 0.53 | 0.33 – 0.87 |
Примечание: тест χ2; p — значимость различий между группами; РЭ — группа пациенток с раком эндометрия; ОШ — отношение шансов; ДИ — доверительный интервал
Note: χ2 test; p — significance of differences between the groups; РЭ — a group of patients with endometrium cancer; ОШ — odds ratio; ДИ — reliability interval
Анализ общей модели наследования (табл. 2) показал, что гомозиготный генотип С/С с мутантным аллелем С гена СYP19А1 при раке эндометрия встречается с частотой 0,517 против 0,337 у женщин контрольной группы (χ2=6,50, р=0,04). Шанс развития рака эндометрия при генотипе С/С был статистически значимо выше (ОШ=2,11, 95% ДИ 1,10 – 4,05, р=0,04).
Таблица 2. Общая модель наследования для CYP19A1 (rs2414098)
Table 2. General model of inheritance CYP19A1 (rs2414098)
Генотипы | Случаи | Контроли | χ2 | p | ОШ | |
n=60 | n=101 | значение | 95% ДИ | |||
Генотип C/C | 0.517 | 0.337 | 6.50 | 0.04 | 2.11 | 1.10 – 4.05 |
Генотип C/A | 0.417 | 0.495 | 0.73 | 0.38 – 1.39 | ||
Генотип A/A | 0.067 | 0.168 | 0.35 | 0.11 – 1.10 |
Примечание: тест χ2; p — значимость различий между группами; РЭ — группа пациенток с раком эндометрия; ОШ — отношение шансов; ДИ — доверительный интервал
Note: χ2 test; p — significance of differences between the groups; РЭ — a group of patients with endometrium cancer; ОШ — odds ratio; ДИ — reliability interval
Гомозиготный вариант А/А SNP гена молекулы СYP19А1 встречался статистически значимо реже у женщин 2 группы сравнения в сопоставлении с контрольной группой и составил соответственно 0,067 и 0,168 (χ2=6,50, р=0,04). Шанс развития рака эндометрия оказался статистически значимо ниже у носителей гомозиготного генотипа А/А (ОШ=0,35, 95% ДИ 0,11–1,10, р=0,04).
Гетерозиготный генотип С/A выявлялся с частотой 0,417 у пациенток с эндометрииодной аденокарциномой и 0,495 у женщин без патологии эндометрия (χ2=6,50, р=0,04). При выявлении варианта С/A гена СYP19А1 шанс развития рака эндометрия составил 0,73 (95% ДИ 0,38–1,39, р=0,04).
Известно, что ген CYP19A1 кодирует участок ферментов цитохрома P450. Этот белок локализуется в эндоплазматической сети и катализирует последние этапы биосинтеза эстрогена, мутации в котором могут приводить к увеличению или уменьшению активности ароматазы [9]. В феврале 2019 года группа ученых из Бразилии установила, что CYP19A1 связан с дисбалансом эстрадиола в сыворотке крови, он может способствовать образованию конечного метаболита эстрадиола в фолликулярной жидкости, а также влиять на созревание ооцитов [10]. Кроме того, ген CYP19A1 способствует прогрессированию холангиокарциномы через усиление миграции и пролиферации раковых клеток [11], а у пациентов с раком молочной железы ген связан с более высокой скоростью роста и размера опухоли [12]. Также как у женщин в Европейской популяции, для жительниц Республики Татарстан был выявлен риск развития рака эндометрия при наличии мутантного аллеля гена СYP19А1. Наличие подобного полиморфизма позволяет выделить группу онкориска по развитию рака эндометрия и разработать стратегию ведения этих пациенток гинекологами для предотвращения его фенотипического проявления.
Выводы
Шанс развития рака эндометрия оказался выше у носителей аллеля С (ОШ=1,88, 95% ДИ 1.15 – 3.06, р=0,01) и генотипа С/С (ОШ=2,11, 95% ДИ 1.10 – 4.05, р=0,04) SNP гена молекулы СYP19А1 (rs2414098).
Наличие аллеля С и генотип аС/С SNP гена молекулы СYP19А1 являются факторами, повышающим риск развития эндометриодной аденокарциномы у женщин, проживающих на территории Республики Татарстан.
Габидуллина Р.И.
https://orcid.org/0000-0002-7567-6043
Смирнова Г.А.
https://orcid.org/0000-0002-5915-558X
Нухбала Ф.Р. оглы
https://orcid.org/0000-0002-1244-7577
Валеева Е.В.
https://orcid.org/0000-0001-7080-3878
Орлова Ю.И.
https://orcid.org/0000-0002-1992-9763
Шакиров А.А.
https://orcid.org/0000-0001-9883-6989
Ахметзянова А.Ф.
https://orcid.org/0000-0002-3285-193X
Фахрутдинова Г.Р.
https://orcid.org/0000-0002-0180-7477
Конфликт интересов
Авторы статьи подтвердили отсутствие конфликта интересов, финансовой поддержки, о которых необходимо сообщить.
ЛИТЕРАТУРА
- Каприн А.Д., Старинский В.В., Петрова Г.В. Злокачественные новообразования в России в 2017 году (заболеваемость и смертность). — М.: МНИОИ им. П.А. Герцена — филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России, 2018. — 250 с.
- Siegel R., Ma J., Zou Z., Jemal A. Cancer statistics, 2019 // CA Cancer J. Clin. — 2019. — Vol. 69, №1. — P. 7-34.
- Ferlay J. et al. Cancer incidence and mortality patterns in Europe: Estimates for 40 countries and 25 major cancers in 2018 // Eur. J. Cancer. — 2018. — №103. — P. 356-387.
- Win A.K., Reece J.C., Ryan S. Family history and risk of endometrial cancer: a systematic review and meta-analysis // Obstet. Gynecol. — 2015. — Vol. 125, №1. — P. 89-98.
- Barrow E., Hill J., Evans D.G. Cancer risk in Lynch Syndrome // Fam. Cancer. — 2013. — Vщд. 12, №2. — P. 29-40.
- Church D.N. et al. DNA polymerase ε and δ exonuclease domain mutations in endometrial cancer // Hum Mol Genet. — 2013. — Vol. 22, №14. — P. 2820-2828.
- Timothy H.T. Cheng et al. Five endometrial cancer risk loci identified through genome-wide association analysis // Nat. Genet. — 2016. — Vol. 48, №6. — P. 667-674.
- Amanda B. Spurdle et al. Genome-wide association study identifies a common variant associated with risk of endometrial cancer // Nat. Genet. — 2011. — Vol. 43, №5. — P. 451-454.
- Toda K., Shizuta Y. Molecular cloning of a cDNA showing alternative splicing of the 5′-untranslated sequence of mRNA for human aromatase P-450 // Eur. J. Biochem. — 1993. — Vol. 213, №1. — P. 383-389.
- Amaro A. et al. The Impact of Variants in Genes Associated with Estradiol Synthesis on Hormone Levels and Oocyte Retrieval in Patients Who Underwent Controlled Ovarian Hyperstimulation // Genet. Test Mol. Biomarkers. — 2019. — Vol. 23, №2. — P. 145-149.
- Kaewlert W. et al. The Importance of CYP19A1 in Estrogen Receptor-Positive Cholangiocarcinoma // Horm Cancer. — 2018. — Vol. 9, №6. — P. 408-419.
- Du Z.G. et al. Association of CYP19A1 gene rs7176005 single nucleotide polymorphism with breast cancer risk and clinicopathologic features of tumor // Zhonghua Yu Fang Yi Xue Za Zhi. — 2018. — Vol. 52, №8. — P. 827-832.
REFERENCES
- Kaprin A.D., Starinskiy V.V., Petrova G.V. Zlokachestvennye novoobrazovaniya v Rossii v 2017 godu (zabolevaemost’ i smertnost’) [Malignant neoplasms in Russia in 2017 (morbidity and mortality)]. Moscow: MNIOI im. P.A. Gertsena – filial FGBU «NMITs radiologii» Minzdrava Rossii, 2018. 250 p.
- Siegel R., Ma J., Zou Z., Jemal A. Cancer statistics, 2019. CA Cancer J. Clin, 2019, vol. 69, no.1, pp. 7-34.
- Ferlay J. et al. Cancer incidence and mortality patterns in Europe: Estimates for 40 countries and 25 major cancers in 2018. Eur. J. Cancer, 2018, no. 103, pp. 356-387.
- Win A.K., Reece J.C., Ryan S. Family history and risk of endometrial cancer: a systematic review and meta-analysis. Obstet. Gynecol, 2015, vol. 125, no. 1, pp. 89-98.
- Barrow E., Hill J., Evans D.G. Cancer risk in Lynch Syndrome. Fam. Cancer, 2013, Vshchd. 12, no. 2, pp. 29-40.
- Church D.N. et al. DNA polymerase ε and δ exonuclease domain mutations in endometrial cancer. Hum Mol Genet, 2013, vol. 22, no. 14, pp. 2820-2828.
- Timothy H.T. Cheng et al. Five endometrial cancer risk loci identified through genome-wide association analysis. Nat. Genet, 2016, vol. 48, no. 6, pp. 667-674.
- Amanda B. Spurdle et al. Genome-wide association study identifies a common variant associated with risk of endometrial cancer. Nat. Genet, 2011, vol. 43, no. 5, pp. 451-454.
- Toda K., Shizuta Y. Molecular cloning of a cDNA showing alternative splicing of the 5′-untranslated sequence of mRNA for human aromatase P-450. Eur. J. Biochem, 1993, vol. 213, no. 1, pp. 383-389.
- Amaro A. et al. The Impact of Variants in Genes Associated with Estradiol Synthesis on Hormone Levels and Oocyte Retrieval in Patients Who Underwent Controlled Ovarian Hyperstimulation. Genet. Test Mol. Biomarkers, 2019, vol. 23, no. 2, pp. 145-149.
- Kaewlert W. et al. The Importance of CYP19A1 in Estrogen Receptor-Positive Cholangiocarcinoma. Horm Cancer, 2018, vol. 9, no. 6, pp. 408-419.
- Du Z.G. et al. Association of CYP19A1 gene rs7176005 single nucleotide polymorphism with breast cancer risk and clinicopathologic features of tumor. Zhonghua Yu Fang Yi Xue Za Zhi, 2018, vol. 52, no. 8, pp. 827-832.